В пресс-службе «Сколтеха» сообщили, что российские молекулярные биологи определили наиболее эффективный способ подготовки образцов для изучения микробных сообществ на вулканах. Исследование проводилось с использованием пород, собранных на фумарольных полях трех вулканов — Эльбруса, Ушковского и японского Фудзи.
Особенности вулканической среды, где сочетаются экстремальные температуры, газы и вечная мерзлота, создают сложные условия для выживания микроорганизмов. Бактерии и археи, обитающие в таких условиях, выработали уникальные адаптационные механизмы, представляющие интерес для биотехнологий.
Однако извлечь ДНК из вулканического грунта крайне сложно из-за малого количества микробов и разрушения их генетического материала при стандартной обработке. Чтобы решить эту задачу, ученые сравнили два метода гомогенизации — горизонтальный и вертикальный.
Полевые испытания показали, что вертикальная гомогенизация эффективнее: она позволяет извлекать больше ДНК и выявлять большее количество архей. Этот метод оказался предпочтительным при анализе образцов, собранных в разных климатических условиях.